Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms