Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sdc1P18828 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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