Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Defa1P11477 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms