Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lamp1P11438 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms