Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4P10628 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms