Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms