Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifna6P07350 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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