Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sp1O89090 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms