Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CopeO89079 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CopeO89079 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CopeO89079 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms