Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops6O88545 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cops6O88545 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cops6O88545 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops6O88545 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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