Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Col5a1O88207 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a1O88207 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms