Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp4O70480 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms