Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Foxq1O70220 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Foxq1O70220 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms