Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Copb2O55029 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Copb2O55029 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Copb2O55029 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Copb2O55029 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Copb2O55029 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Copb2O55029 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Copb2O55029 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Copb2O55029 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Copb2O55029 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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