Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DffaO54786 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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DffaO54786 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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DffaO54786 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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DffaO54786 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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DffaO54786 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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DffaO54786 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DffaO54786 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
DffaO54786 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
DffaO54786 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
DffaO54786 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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