Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FxnO35943 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FxnO35943 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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FxnO35943 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FxnO35943 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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