Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nek2O35942 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms