Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms