Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stx1aO35526 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stx1aO35526 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms