Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmiO35309 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmiO35309 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NmiO35309 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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NmiO35309 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmiO35309 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmiO35309 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmiO35309 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmiO35309 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmiO35309 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NmiO35309 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NmiO35309 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NmiO35309 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NmiO35309 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NmiO35309 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NmiO35309 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NmiO35309 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NmiO35309 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NmiO35309 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms