Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Kcns1O35173 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcns1O35173 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms