Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Kif1cO35071 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Kif1cO35071 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kif1cO35071 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms