Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms