Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MttpO08601 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MttpO08601 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MttpO08601 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms