Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms