Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm379J3QQ19 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm379J3QQ19 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm379J3QQ19 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm379J3QQ19 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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