Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Gm2056J3QQ02 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Gm2056J3QQ02 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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