Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm2035J3QP87 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm2035J3QP87 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm2035J3QP87 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm2035J3QP87 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm2035J3QP87 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm2035J3QP87 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm2035J3QP87 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm2035J3QP87 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm2035J3QP87 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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