Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20825J3QM67 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms