Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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