Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm21060J3KMU4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm21060J3KMU4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm21060J3KMU4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Gm21060J3KMU4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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