Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm21818J3KMS6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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