Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21411J3KMS0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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