Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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