Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Taf4bG5E8Z2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms