Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9yF8VPU6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms