Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmgcF6VRN1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms