Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rdh16f1E9Q9P8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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