Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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Myo5cE9Q1F5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Myo5cE9Q1F5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Myo5cE9Q1F5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Myo5cE9Q1F5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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Myo5cE9Q1F5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Myo5cE9Q1F5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Myo5cE9Q1F5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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