Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms