Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms