Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms