Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zscan18E9PUD6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms