Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms