Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf217D3YYI7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf217D3YYI7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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