Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Syce3B5KM66 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Syce3B5KM66 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Syce3B5KM66 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Syce3B5KM66 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce3B5KM66 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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