Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnldc1B2RXZ1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms