Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cspp1B2RX88 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspp1B2RX88 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms