Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rd3lB2RV38 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rd3lB2RV38 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms