Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PtprbB2RU80 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms